O prédio histórico estava alagado havia 18 dias devido às águas do Guaíba, que atingiram o nível recorde de 5,35 metros em 5 de maio, superando o pico da cheia registrado em 1941, que foi de 4,76 metros. A cota de inundação no local é de 3 metros e o cenário encontrado após a inundação é preocupante, com lixo acumulado e estruturas das lojas danificadas.
Na quarta-feira (22), uma força-tarefa dos servidores do Departamento Municipal de Limpeza Urbana de Porto Alegre iniciou a limpeza da parte externa do mercado público. O serviço incluiu a remoção do lodo através de hidrojateamento e o uso de caminhão-pipa para transporte de água. Após a retomada, está prevista a desinfecção do local, com um custo estimado pela prefeitura em R$ 284 mil, e a operação deve durar até cinco dias.
Após a segunda etapa da limpeza, os comerciantes do Mercado Público terão a oportunidade de avaliar os prejuízos e descartar resíduos e entulhos com a ajuda das equipes do Departamento Municipal de Limpeza Urbana. A terceira etapa prevê a desinfecção da área térrea e a limpeza e desinfecção do piso superior do mercado. A prefeitura está empenhada em garantir a recuperação desse espaço histórico que faz parte da identidade da cidade de Porto Alegre.